根据孝南办发【2002】26号文件，孝南区委统战部是中共孝南区委主管统一战线工作的职能部门，区委台湾工作办公室（区政府台湾事务办公室）与统战部合署办公，实行一个机构、两块牌子、一套班子体制。内设办公室、干部科、党派科、民族宗教科（民族宗教局）。

2010年6月，民族宗教科（民族宗教局）单设为孝南区民族宗教局，属区政府工作部门。

2011年6月，根据区委常委会议精神和孝南机编[2011]10号文件，同意区委台湾工作办公室、（区政府台湾事务办公室）单独设立，核定行政编制2名。

至此，统战部内设办公室、干部科、党派科。其主要工作职能是组织执行贯彻党的统战和民族宗教方针、政策，掌握统一战线中的政治思想动态，负责党外人士、少数民族干部的培养举荐工作，开展统—战线宣传、信息工作等。